Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxd11P23813 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Hoxd11P23813 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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