Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja1P23242 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja1P23242 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms