Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms