Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou5f1P20263 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms