Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ntf3P20181 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms