Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd1P19182 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms