Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18524 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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P18524 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18524 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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P18524 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18524 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P18524 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18524 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18524 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18524 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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P18524 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18524 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18524 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18524 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18524 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18524 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18524 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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P18524 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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P18524 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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P18524 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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P18524 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18524 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18524 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18524 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18524 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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