Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpraP18052 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpraP18052 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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