Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb1P17919 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms