Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tgfb3P17125 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tgfb3P17125 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms