Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prph2P15499 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prph2P15499 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prph2P15499 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms