Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb2P13373 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms