Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms