Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nid1P10493 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nid1P10493 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nid1P10493 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms