Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms