Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc9P09633 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc9P09633 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc9P09633 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms