Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb7P09024 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb7P09024 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms