Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spta1P08032 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spta1P08032 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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