Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Prm2P07978 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms