Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtrP07309 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TtrP07309 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
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TtrP07309 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TtrP07309 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtrP07309 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtrP07309 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtrP07309 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtrP07309 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtrP07309 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtrP07309 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtrP07309 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TtrP07309 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TtrP07309 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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