Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoa4P06728 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoa4P06728 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms