Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06321 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06321 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06321 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06321 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06321 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06321 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06321 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06321 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06321 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms