Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Eb1P04230 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms