Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt1P04104 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms