Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01679 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01679 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01679 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01679 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01679 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01679 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01679 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01679 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01679 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01679 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01679 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01679 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01679 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
P01679 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01679 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01679 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01679 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P01679 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01679 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms