Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01647 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01647 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01647 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01647 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01647 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01647 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01647 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01647 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01647 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01647 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01647 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01647 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms