Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl20O89093 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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