Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apaf1O88879 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms