Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mmp23O88676 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mmp23O88676 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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