Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng2O88602 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng2O88602 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.7 ms