Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CaskO70589 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CaskO70589 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CaskO70589 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaskO70589 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaskO70589 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaskO70589 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaskO70589 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CaskO70589 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CaskO70589 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CaskO70589 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CaskO70589 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaskO70589 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms