Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lnx1O70263 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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