Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BckdkO55028 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BckdkO55028 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BckdkO55028 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms