Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csnk2a2O54833 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms