Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EdaO54693 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EdaO54693 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EdaO54693 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EdaO54693 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EdaO54693 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EdaO54693 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EdaO54693 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EdaO54693 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms