Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5r2O35926 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms