Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sp100O35892 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sp100O35892 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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