Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp2O35711 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms