Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NudcO35685 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NudcO35685 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NudcO35685 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NudcO35685 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NudcO35685 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NudcO35685 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NudcO35685 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NudcO35685 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NudcO35685 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NudcO35685 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NudcO35685 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NudcO35685 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms