Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6aO35464 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms