Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KeraO35367 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KeraO35367 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KeraO35367 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KeraO35367 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms