Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc18a3O35304 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc18a3O35304 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms