Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptpn9O35239 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms