Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd9O35177 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Nedd9O35177 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Nedd9O35177 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Nedd9O35177 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Nedd9O35177 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Nedd9O35177 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd9O35177 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd9O35177 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Nedd9O35177 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Nedd9O35177 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd9O35177 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd9O35177 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd9O35177 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd9O35177 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd9O35177 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd9O35177 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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