Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx4O35137 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alx4O35137 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms