Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Casq1O09165 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casq1O09165 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casq1O09165 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms