Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sypl1O09117 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sypl1O09117 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms