Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8050L7N2E3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8050L7N2E3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms