Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6401L7N2C0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms