Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 1500004A13Rik-205ENSMUST00000184014 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms